python matplotlib

#comando para instalar matplotlib
pip install matplotlib

import matplotlib.pyplot as plt
import numpy as np

# Definir la función a graficar
def f(x):
    return np.sin(x)

# Definir los valores de x
x = np.linspace(0, 2*np.pi, 100)

# Calcular los valores de y
y = f(x)

# Crear la gráfica
plt.plot(x, y)

# Añadir etiquetas a los ejes
plt.xlabel('x')
plt.ylabel('y')

# Mostrar la gráfica
plt.show()

import numpy as np
import matplotlib.pyplot as plt
from mpl_toolkits import mplot3d

# Creamos datos de ejemplo
x = np.linspace(-5, 5, 100)
y = np.linspace(-5, 5, 100)
X, Y = np.meshgrid(x, y)
Z = np.sin(np.sqrt(X**2 + Y**2))

# Creamos la figura y los ejes 3D
fig = plt.figure()
ax = plt.axes(projection='3d')

# Graficamos la superficie
ax.plot_surface(X, Y, Z, cmap='viridis')

# Agregamos etiquetas y título
ax.set_xlabel('x')
ax.set_ylabel('y')
ax.set_zlabel('z')
ax.set_title('Gráfico 3D de una función sinoidal')

# Mostramos el gráfico
plt.show()

pip install biopython

pip install requests

from Bio import SeqIO
import matplotlib.pyplot as plt

# Abre el archivo FASTQ de secuenciación
with open("SRR23513858.fastq", "r") as handle:
    # Itera sobre cada registro de secuencia
    for record in SeqIO.parse(handle, "fastq"):
        qualities = record.letter_annotations["phred_quality"]
        # Crea una gráfica de barras para la calidad de los datos de la secuencia
        plt.bar(range(len(qualities)), qualities)
        plt.title("Quality scores for sequence " + record.id)
        plt.xlabel("Base position")
        plt.ylabel("Phred quality score")
        plt.show()